Exposure to ideas in domains outside a scientist's own may benefit her in reformulating existing research problems in novel ways and discovering new application domains for existing solution ideas. While improved performance in scholarly search engines can help scientists efficiently identify relevant advances in domains they may already be familiar with, it may fall short of helping them explore diverse ideas \textit{outside} such domains. In this paper we explore the design of systems aimed at augmenting the end-user ability in cross-domain exploration with flexible query specification. To this end, we develop an exploratory search system in which end-users can select a portion of text core to their interest from a paper abstract and retrieve papers that have a high similarity to the user-selected core aspect but differ in terms of domains. Furthermore, end-users can `zoom in' to specific domain clusters to retrieve more papers from them and understand nuanced differences within the clusters. Our case studies with scientists uncover opportunities and design implications for systems aimed at facilitating cross-domain exploration and inspiration.
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机器学习（ML）为生物处理工程的发展做出了重大贡献，但其应用仍然有限，阻碍了生物过程自动化的巨大潜力。用于模型构建自动化的ML可以看作是引入另一种抽象水平的一种方式，将专家的人类集中在生物过程开发的最认知任务中。首先，概率编程用于预测模型的自动构建。其次，机器学习会通过计划实验来测试假设并进行调查以收集信息性数据来自动评估替代决策，以收集基于模型预测不确定性的模型选择的信息数据。这篇评论提供了有关生物处理开发中基于ML的自动化的全面概述。一方面，生物技术和生物工程社区应意识到现有ML解决方案在生物技术和生物制药中的应用的限制。另一方面，必须确定缺失的链接，以使ML和人工智能（AI）解决方案轻松实施在有价值的生物社区解决方案中。我们总结了几个重要的生物处理系统的ML实施，并提出了两个至关重要的挑战，这些挑战仍然是生物技术自动化的瓶颈，并减少了生物技术开发的不确定性。没有一个合适的程序；但是，这项综述应有助于确定结合生物技术和ML领域的潜在自动化。
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隐私性和解释性是实现值得信赖的机器学习的两种重要成分。我们通过图形重建攻击研究了图机学习中这两个方面的相互作用。这里的对手的目的是重建给定模型解释的训练数据的图形结构。根据对手可用的不同种类的辅助信息，我们提出了几种图形重建攻击。我们表明，事后功能解释的其他知识大大提高了这些攻击的成功率。此外，我们详细研究了攻击性能相对于三种不同类别的图形神经网络的解释方法的差异：基于梯度，基于扰动和基于替代模型的方法。虽然基于梯度的解释在图形结构方面显示最多，但我们发现这些解释并不总是在实用程序上得分很高。对于其他两类的解释，隐私泄漏随着解释实用程序的增加而增加。最后，我们提出了基于随机响应机制的防御，以释放大大降低攻击成功率的解释。我们的匿名代码可用。
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解释机器学习决策的问题是经过深入研究和重要的。我们对一种涉及称为图形神经网络的图形数据的特定类型的机器学习模型感兴趣。众所周知，由于缺乏公认的基准，评估图形神经网络（GNN）的可解释性方法是具有挑战性的。鉴于GNN模型，存在几种可解释性方法来解释具有多种（有时相互矛盾的）方法论的GNN模型。在本文中，我们提出了一个基准，用于评估称为Bagel的GNN的解释性方法。在百吉饼中，我们首先提出了四种不同的GNN解释评估制度 - 1）忠诚，2）稀疏性，3）正确性。 4）合理性。我们在现有文献中调和多个评估指标，并涵盖了各种概念以进行整体评估。我们的图数据集范围从引文网络，文档图，到分子和蛋白质的图。我们对四个GNN模型和九个有关节点和图形分类任务的事后解释方法进行了广泛的实证研究。我们打开基准和参考实现，并在https://github.com/mandeep-rathee/bagel-benchmark上提供它们。
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